高斯 func1.cub是什么文件

Multiwfn图形化软件的文件。

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使用Multiwfn图形化研究弱相互作用

文/Sobereva

虽然能显示高斯类型格点文件的等值面的程序很多，但支持将一个函数数值用不同颜色填到另外一个函数的等值面上的可视化程序比较有限，常用的GaussView虽然支持，但 *** 作不便而且不够强大。VMD是观看、分析分子动力学结果最重要的软件之一，它在映射颜色和显示等值面方面也很好用，等值面又光滑又有光泽，填色的色彩变化细腻，调整等值面也比较容易，而且运行流畅。VMD可以免费在。。。下载。

首先安装VMD，然后将func1cub和func2cub复制到VMD安装后的目录下，即vmdexe所在路径。然后在此目录下编写一个文本文件，后缀为vmd，比如ltwdvmd。在里面填上如下内容：

mol new func1cub

mol addfile func2cub

mol delrep 0 top

mol representation CPK 10 03 180 160

mol addrep top

mol representation Isosurface 050000 1 0 0 1 1

mol color Volume 0

mol addrep top

mol scaleminmax top 1 -004 002

color scale method BGR

保存文件后，启动VMD，选File-Load

State，选择ltwdvmd，图13下方的图就显示来了。若想把背景改成黑色，选Graphics-Colors-Display-Background-8

White。图中的弯曲的片状等值面边缘略有锯齿，可以通过增加此处格点密度来改善。从颜色上可看出，弯曲的片状等值面描述的是二聚体之间范德华作用，但部分区域也有微弱的位阻效应。圆片等值面只有中间呈蓝色，说明H与O之间形成了氢键，但并不像甲酸二聚体的氢键那么强。

VMD里面每个 *** 作对应一条语句，载入vmd本质上就是让vmd文件中的语句全部执行，这就免得每次都手动执行载入文件、设定参数的一系列繁琐步骤。比如mol

new func1cub的含义就是读入当前路径下func1cub文件（默认的当前路径一般就是vmdexe所在路径），mol scaleminmax top

1 -004 002代表将1号representation（对应于显示填色等值面的那个图层）色彩刻度的下上限分别设为-004和002，color

scale method BGR代表将色彩刻度由小到大设为蓝->绿->红。将背景设为白色的命令是color Display Background

white，若将此命令添加到vmd里面就能在载入vmd文件时顺便执行，使背景自动设为白色。这些命令在VMD手册上都有解释。这些命令也可以在VMD的控制台下直接运行，控制台通过Extensions-Tk

Console进入，比如想把色彩刻度改为从-005到005，就在控制台执行mol scaleminmax top 1 -005

005。有很多命令在VMD的GUI上有相应的选项，其中有些通过GUI *** 作会容易得多，比如调整等值面数值，可以在Graphics-Representations里面的列表中选定第二个显示模式（即Style为isosurface的那个），然后将下方Range的下上限分别设为比如0和1，点回车，之后拉动滑条就能在0~1范围内改变等值面。

另外，Chemcraft也可以实现相同功能，对初学者来说使用更简单，不过效果不

如VMD，而且收费。使用方法：

先打开func2cub，再点左下角Add cube，选择func1cub。将Contour value设为05，敲回车，然后点Show

isosurface。然后把Map other:选为2，再把Values range分别填-004和002，敲回车。

这种分析方法也可以用于分析晶体间内部弱相互作用。虽然Gaussian的PBC功能并不给力，但是简单的PBC计算还是可以胜任的。由于Gaussian的PBC计算是以高斯型函数作为基函数，所以波函数信息可以直接被Multiwfn读入并进行分析。这里将以金刚石晶体作为例子。

还是先获得波函数文件。Gaussian的输入文件就是压缩包里的

pbc_diamondgjf。运行之后，用formchk将chk转化为fch文件。当然，用wfn作为Multiwfn的波函数输入也可以。由于计算的是素晶胞，波函数信息也只含有两个碳原子的，获得的等值面显然体现不出周期性，然而计算复晶胞又太费时。在Multiwfn里提供了一个晶胞波函数平移复制功能，可以将这素晶胞波函数信息扩展为足够大的复晶胞波函数。复制次数越多，体系中高斯函数越多，计算格点时越慢，为避免计算格点时间太长，这里只向各方向平移复制两次。

启动Multiwfn后输入：

c:\pbc_diamondfch

6 //修改波函数功能

32 //平移复制体系

47523,0,0 //第一个平移向量。平移向量在输出文件中的PBC vector段落，或者查看fch中的Translation

vectors字段。不要用输入文件中的平移向量，因为Gaussian可能自动改动坐标，平移向量也就变了。

1 //单位为bohr

2 //复制两次。接下来再对另外两个方向做相同的平移复制。

联想12代cpu笔记本装win11系统蓝屏原因分析及解决方法

编辑：xtceo

时间：2022-06-22

最近有网友问刚购买的联想12代cpu笔记本怎么安装win11呀？在安装win11时发现找不到硬盘，采用的比较新的win10 pe也无法看到硬盘？用其它pe安装win10后还出现蓝屏的情况，并且bios中也没有相关硬盘模式的选择项，研究后发现是由于intel 新技术VMD默认开启了，将VMD关闭后才能设置相关的硬盘模式，或采用小兵pe才能正常安装win11,下面小编就给大家介绍详细的 *** 作步骤。

一、联想12代cpu笔记本装win11系统蓝屏解决方法准备工作

1、8G左右的U盘推荐使用小兵u盘启动盘制作工具(PE特点：1，绝无捆绑任何软件的启动盘。2，支持PE自动修复UEFI+GPT引导。3、支持win10/win11系统一键注入intel vmd驱动)

联想12代cpu笔记本装win11系统蓝屏解决方法注意事项：

1、联想12代cpu笔记本己经不支持修改引导模式了，默认采用的是uefi引导，分区格式必须为guid(gpt)，uefi引导的系统只支持64位 *** 作系统。

2、由于联想12代cpu的笔记本默认开启了intel vmd技术，所以需要关闭的情况才能更改硬盘模式或采用小兵pe也认别并注入intel vmd驱动。

联想12代cpu笔记本装win11系统蓝屏原因分析：

最新的英特尔第12代处理器（Intel Tiger Lake），该处理器采用最新的Intel VMD（Intel Volume Management Device技术）技术，需要安装了180版本以上的英特尔快速存储技术（Intel RST）驱动才能识别到。不知道自己的电脑是不是采用了VMD技术的可以到设备管理器的存储控制器上看看有没有VMD字样。一般来说用了第12代cpu的，改了硬盘模式后还是进PE看不到硬盘的基本就是采用了新技术的了。我们可以用最简单有些笔记本直接可以关闭intel vmd或采用小兵u盘pe才能正常安装win11，下面小编就教大家详细的方法。

联想12代cpu笔记本装win11系统蓝屏解决方法一：bios中关闭intel vmd

1、开机一直按F1或（FN+F1）进入BIOS，按→方向键切换到configuration选项，如下图所示；



2、然后第一步将configuration选项右侧的Intel VMD Controller默认enabled改成disabled，关闭VMD关闭vmd后第二步才能再将SATA Controller Mode改成AHCI模式，否则PE里面可能看不到硬盘或者是在安装系统时也无法看到硬盘，同时关闭intel vmd后解决蓝屏问题，如下图所示；



3、更改完后，我们按F10进行保存，再选择制作好的U盘启动盘，开机一直按F12或FN+12选择U盘进入PE，如下图所示；



联想12代cpu笔记本装win11系统蓝屏解决方法二：加载intel vmd驱动

1、下载Intel Rapid Storage Technology (IRST)驱动程序完成后，鼠标右键点击[V18041146_IRST_VMD_20H1]压缩文件①并选择[全部解压缩]②，如下图所示；



2、选择目标③并点选[提取]④，如下图所示；



3、解压缩完成后，请将解压缩后的文件夹(V18041146_IRST_VMD_20H1)整个复制到U盘。如果您的Windows 10安装媒体也是使用U盘，请将此文件夹复制到Windows 10安装媒体的U盘，如下图所示；



4、将包含Windows 10安装媒体及Intel Rapid Storage Technology (IRST)驱动程序(V18041146_IRST_VMD_20H1文件夹)的U盘连接至计算机。(如果您是用Windows 10光盘进行安装，请将光盘与上述档案所放置的U盘一并插入计算机)在您想将Windows安装在哪里的画面找不到任何驱动器时，请点选[加载驱动程序]①，如下图所示；



5、加载驱动后会提示找不到驱动，我们这时点选[浏览]④，找到[V18041146_IRST_VMD_20H1]文件夹⑤，然后点选[确定]⑥，如下图所示；



6、选择[Intel RST VMD Controller 9A08 (TGL) ]⑦，然后点选[下一步]⑧将会开始安装驱动程序，如下图所示；



7、驱动程序安装完成后，驱动器即可正常显示，如下图所示；



剩下的我们就可以正常往下走安装win10系统了。

联想12代cpu笔记本装win11系统蓝屏解决方法三：采用小兵pe注入intel vmd驱动

用小兵制作的PE，可自动认别硬盘，并在安装win10时自动注入intel vmd驱动，如没注入可以部分驱动没有，就需要在bios中关闭intel vmd设置。



2、用小兵pe中的小兵系统安装工具，可以在安装win11时一键注入intel vmd或intel rst驱动，解决安装win11系统后蓝屏问题。



以上就是联想12代cpu笔记本装win11系统蓝屏解决方法，大家可以学习一下。更多教程请关注电脑系统城

用materials studio建模转化成lammps data文件，我是用lammps里的msi2lmp工具转化的。

那个msi2lmp工具，手册第七章里面也有介绍，下载的lammps文件，tool目录下也有源代码和例子，你可以做相应的参考。

使用MS将PDB导出成car，mdf格式。

有关msi2lmp工具的使用(执行msi2lmpexe 的权限 更改文件的使用权限):

按照以下顺序来的：

1，直接把msi2lmpexe拷贝到指定文件夹下；

2，在ms中建立好结构模型后，在ds模块或者forcite模块中指定力场类型，如对xxx结构指定为cvff力场，export结构保存为car格式，同时自动有mdf格式的文件生成；

3，将xxxcar和xxxmdf文件拷贝到msi2lmpexe所在的文件夹，并将tools/msi2lmp/biosym_frc_files文件中对应的力场文件拷贝到这个文件夹中（如上面的cvfffrc）；

4，在这个文件目录下，通过终端命令行/msi2lmpexe xxx -class I -frc cvff > dataxxx 运行程序，运行成功生成dataxxx文件和xxxlammps05文件，dataxxx是空的可以直接删除，数据在xxxlammps05文件中。

以上就是关于高斯 func1.cub是什么文件全部的内容，包括:高斯 func1.cub是什么文件、win11系统12代处理器驱动程序是09年、lammps生成的文件怎么导入vmd等相关内容解答，如果想了解更多相关内容，可以关注我们，你们的支持是我们更新的动力！