0[生信技能树]生信服务器配置全攻略

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nginx可以给一个IP地址分配多个域名

写入'hello, world'

安装后，浏览器输入
>chmod 755 shellsh 表示任何人对shellsh文件可读可执行。7=4+2+1。5=4+1。

当文件有了可执行权限时候，不一定可执行。需要涉及到环境变量的概念。 如/usr/bin 目录下，大部分的系统命令都在这个目录下。

系统中环境变量的名字是：PATH。输入：echo $PATH 显示已有的内容。如果我们想自己的命令能够被系统找到，就需加入环境变量。具体 *** 作如下：

查看当前：echo $PATH 

显示：/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/usr/local/games

添加：export PATH=${PATH}:/home/zhanghan

查看：echo $PATH

显示：/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/usr/local/games:/home/zhanghan

以上只是对当前终端有效，退出后就无效了，

所以：在安装了新的软件，或者写了新的脚本后，都把软件的可执行程序和可执行的脚本所在目录，加到环境变量里面就可以了。

怎么写文件，当以后界面关闭后还能一直保存环境变量的改变

服务器输入命令：ls -la 。若是没有 bash_profile文件则新建，在文件bash_profile中加入：export PATH=${PATH}:/home/zhanghan保存退出，则每次系统自动检索到。

PATH只是众多环境变量中的一个变量，用于存储可执行文件所在的目录，以便在用户输入命令的时候可以查询的到。尤其是自己写的脚本或者安装的程序，系统不会知道它们在哪个路劲下，需要我们去提供给系统新的路径，学名叫设置环境变量。

宝贵的春节假期转瞬即逝，广大的师生朋友们又回到了生信学术科研的怀抱。

当然，也有的朋友从未离开过学术的怀抱。

所谓学术一时爽，一直学术一直爽（不是。

但出于一些众所周知的原因，总有那么些时候，搞学术并没有那么爽。

故事还要从我的那些朋友们说起……

实验室斥巨资购买了专属服务器。

然而服务器一周两天学术三天维护两天吃灰。

服务器不用来搞学术的时候，内心饱受羞愧和不甘的双重折磨。

但如果天天搞学术，朋友则在人机大战中日渐消瘦，感觉身体被掏空。

试问导师的期望谁来承受？

昂贵的服务器谁来回本？

朋友的秀发谁来呵护？

难道只能如此……

实验室也斥巨资购买了专属服务器。

为了获得师弟赞赏的目光，主动接下了“贫穷”的实验室维护服务器的重任。

周一周二服务器体验良好。

周三开始装包失败+装逼失败。

周四硬盘崩溃全无备份，收获极致的濒死体验。
周五发现服务器中了挖矿病毒，学术遭到社会毒打。

下周一上班顺带忘了上周一设置的完美root密码。

是苦练技艺重新赢回师弟的信任？

还是告别导师寻找更适合自己的广阔天地？

难道只能如此……

实验室又斥巨资购买了专属服务器。

一心学术的他却饱受服务器和师兄的困扰。

一周里面，花一天去找师兄装包和交流感情。

再花一天防范硬盘崩溃自己准备双重备份。

还要花一天自学Linux清除系统病毒。

只剩下两天和周末可以废寝忘食搞学术。

试问何日才能实现 SCI 自由的小目标？

何日才能提早毕业摆脱师兄无微不至的关怀？

难道只能如此……
NO~NO~NO~NO~

如果你和我的朋友们一样，也有类似的小烦恼，

那就快去看看 SHPC 吧！

什么？你还不知道什么是SHPC

SHPC就是共享-高性能计算云服务器。

选择共享服务器相比独享服务器，最大的优势之一首先当然是： 极致性价比

不用一两万，不用三四千，最低只需三百多，包一年，平均一天不到1块钱！

平均一天不到1块钱，就能立刻拥有自己的高性能科研服务器。

乘风直上九万里，实现人生小目标。

更重要的是，还能帮您找回面对老板时三分傲视七分淡然的心态，它难道不香吗？

那这个时候有的朋友就要问了，共享服务器，是不是自己存储空间里的东西，大家都能看到呢？

这点请无需担心。

SHPC 共享的是算力，独享的是存储 。

私有空间 绝对独享且私密 。

除此之外，存储空间提供 三重备份 ，焊死数据安全之门，为您的学术之车保驾护航。

那有的朋友又要问了，我每天要花不到1块钱买服务器，一年四舍五入就是一个亿，作为尊贵的大客户，难道还需要自己给师弟装包检修运维服务器吗？

别着急，统统都不用。

SHPC为您提供 管家式服务 。

不仅 预装R环境+Rstudio ，还提供 各类依赖安装一对一服务 ，让您不再为Linux下各类烦人的依赖损伤秀发。

除此之外，还有专人 定期巡检系统及硬件，专业运维， 为您免去一切维护烦恼！

这么良心的产品，快点抓紧上车吧！

服务器上预装有软件查看

conda activate kalign #首先激活一下环境
kalign -i inputfa -f clu -o outputfa #这是软件的基础使用命令行
</pre>

最近尝试了一下云计算的服务，发现跟集群是一样的并且有可视化界面，因此将脚本和可视化界面上的参数进行对比，方便理解

某些软件可能需要更高级的gcc版本，但网上大部分的解决办法都是通过yum或者apt-get去升级gcc的版本，然后又是需要root权限的建立软链接ln -s的方法，但是集群的管理员大部分情况99%的可能是不会放root权限的，那此时我们改怎么解决呢？

笔者话：最大的感受就是使用起来真的不是太自由，因为是第一次用有很多东西都不会也不敢乱动，还有种刘姥姥进大观园的感受