如何调AMD游戏3D应用程序设置

如何调AMD游戏3D应用程序设置,第1张

SMOOTHVISION HD:消除混叠(即 Anti-Aliasing)

★ 使用应用程序设置:如果打钩的话 (建议),就以应用程序里面的设置为准,如要自己设置的话,可以设置 2X、4X、8X。

★ 形态过滤 (Morphological filtering):打钩即开启 MLAA 形态抗锯齿,可以减少锯齿,但会影响显卡的速度 (尤其是 CPU 慢的),在 i5-760 + HD5770 上实测 3DMark06,开了后分数约下降 14%,同时画面上的文字也会变得模糊一点,一般是建议“不要勾选”。

★ 过滤器 (Filter):默认为 BOX。

SMOOTHVISION HD:各向异性过滤(即 AF, Anisotropic Filtering)

★ 使用应用程序设置:如果打钩的话,就以应用程序里面的设置为准。

如要自己设置的话,可以设置 2X、4X、8X、16,建议设置 16X,以加强远景的贴图。

镶嵌(即 Tessellation)

★ AMD优化:跟“使用应用程序设置”只能二选一,不建议设置 AMD优化,设置了帧数会失去d性空间。

★ 使用应用程序设置:如果打钩的话 (建议),就以应用程序里面的设置为准。

★ 级别:当不选择“AMD优化”也不选择“使用应用程序设置”,可以自行设置 关、2X、4X、6X、8X、16X、32X、64X。

Catalyst AI

★ 纹理过滤质量:分“性能”、“质量”、“高质量”,建议设置“高质量”。

★ 启用表面格式优化:勾选会打开纹理压缩功能,虽会提升速度,但会降低画质,在 i5-760 + HD5770 上实测 3DMark06,勾选后分数增加不到千分之四,基本等于没有,所以是不建议勾选。

Mipmap 详细程度

分“高性能”、“性能”、“质量”、“高质量”,建议设置“高质量”,让纹理贴图更清晰。

等待垂直刷新

分“始终关闭”、“关闭”、“开启”、“始终开启”,显卡不会太差的话,建议设置“始终开启”,在 i5-760 + HD5770 上实测 3DMark06,“始终关闭”跟“始终开启”基本上在分数上没差异 。

消除混叠模式(即 Anti-Aliasing Mode)

分“多重采样 AA”、“自适应多重采样 AA”、“超级采样 AA”,建议选择“超级采样 AA”,让近处画面更清晰,并消除远处锯齿的闪烁问题,当然,显卡慢的话,可以往性能端设置。

OpenGL 设置

★ 三重缓冲 (Triple Buffering):开启可以减少部分画面垂直刷新的等待时间,不过也会用上比较多的显存,但一般还是建议开启

高考志愿填报至关重要。是进入职业生涯第一次重要的选择,是设计未来人生的的起点。从职业规划和职业发展的角度填报志愿,高考志愿填报就显得尤为重要!以下是我为大家收集整理的关于2022年天津高考志愿平行志愿录取规则解读相关内容,供大家参考!

一、2022年天津高考志愿平行志愿录取规则

1.在津招生高校录取工作在教育部统一领导下,由市招生委员会组织实施。各高校在津招生实行计算机远程网上录取。

2.高校在津招生录取顺序依次为:艺术类、体育类本科批次和提前本科批次,普通本科批次A阶段,普通本科批次B阶段,艺术类、体育类高职(专科)批次及提前高职(专科)批次,普通高职(专科)批次。其中,艺术类、体育类本科和提前本科三个批次同步录取,考生不得兼报;艺术类、体育类高职(专科)批次及提前高职(专科)三个批次同步录取,考生不得兼报。

艺术类及体育类本科批次为招收艺术类、体育类专业的本科高校或专业;提前本科批次分为A、B两个阶段,A阶段为军事、公安、飞行学员、公费师范生、航海类等艰苦专业、全国重点马克思主义学院的马克思主义理论专业、经教育部和我市批准的有关高校综合评价招生以及特殊高校(专业)等;B阶段为地方农村专项计划招生高校(专业)。普通本科批次A阶段为公办本科高校及经批准在本批次录取的高校,普通本科批次B阶段为民办本科高校和独立学院。艺术类及体育类高职(专科)批次为招收艺术类、体育类专业的高职(专科)学校或专业;提前高职(专科)批次为有特殊要求的高职(专科)学校或专业;高职(专科)批次为其他高职(专科)学校或专业。

3.各批次均实行“院校+专业”的志愿填报和投档录取方式。普通类本科院校以“院校专业组”为单位进行招生录取;普通类高职院校原则上以“院校”为单位进行招生录取。艺术类及体育类各批次,原则上均以“院校”为单位进行招生录取,对于有等级性考试选考科目要求的本科院校,可以“院校专业组”为单位进行招生录取。

4.高校在津录取新生要认真执行教育部制定的录取政策和有关规定。高校应结合生源分布情况,确定调阅考生档案要求。在高考录取总成绩达到同批录取控制分数线的考生中,按照顺序志愿投档的批次,高校调阅考生档案的比例原则上控制在120%以内。按照平行志愿投档的批次,高校根据模拟投档情况在正式投档前完成计划调整,调档比例原则上控制在105%以内,并确保符合录取规则的调档考生能够录取。

5.艺术类本科和艺术类高职(专科)批次中的市级统考类专业,体育类本科和体育类高职(专科)批次,提前本科批次B阶段(地方农村专项计划),普通类本科批次(含A、B阶段)、高职(专科)批次录取高校实行平行志愿投档录取的办法;提前本科批次中的其他院校志愿,以及普通本科批次中的特殊类型考生志愿,根据院校公布的录取规则进行投档录取。

平行志愿投档规则:计算机投档系统先对同一科类、相应批次录取控制分数线上符合条件的考生,按高考录取总成绩从高分到低分进行排序,依次检索每位考生填报的院校(专业组)志愿;若考生符合其中一所以上院校(专业组)的投档条件时,则投档到序号在前的高校;若考生只符合其中一所院校(专业组)的投档条件,则直接投档到该院校(专业组)。当若干名普通类考生统一高考招生录取总成绩(含政策照顾)相同时,将按照语文、数学、外语单科成绩,等级性考试三门科目中最高成绩、次高成绩,由高到低排序,全部相同者同时投档。

顺序志愿投档规则:第一志愿录取时,计算机系统先依次检索各个招生院校的一志愿生源,将选报同一招生院校的一志愿考生从高分到低分排序,按照招生院校的招生计划和投档比例进行投档。如果招生院校在第一志愿录取时生源不足未完成招生计划,可以招收第二志愿的考生,第二志愿投档规则与第一志愿相同。

6.在津招生的普通本科高校,以高校招生录取总成绩为主要依据,参考高中学生综合素质评价结果实施录取。高中学生综合素质评价档案的具体使用办法由各院校在招生章程中予以明确。

在津招生的普通高职院校,以语文、数学、外语三门统一高考成绩为主要依据,参考考生的普通高中学业水平考试成绩和综合素质评价结果实施录取。

在津招生的艺术类、体育类高校(专业),分别按照艺术类、体育类专业相应的招生办法实施录取。

7.各批次高校在津招生按照“学校负责、招办监督”的原则实施新生录取工作。高校应按照向社会公布的招生章程中的录取规则进行录取。对思想政治品德考核合格、身体状况符合相关专业培养要求、投档成绩达到同批录取控制分数线并符合高校调档要求的考生,是否录取以及所录取的专业由高校自行确定,高校负责对已投档但未被录取考生的退档原因做出解释,高校不得超计划录取。市高招办为在津招生高校提供符合条件考生的相关信息和服务,组织管理招生录取工作,监督在津招生高校执行国家招生政策、招生计划和招生章程情况,纠正违反国家招生政策、规定和违背录取规则等行为。

8.各批次录取时,市高招办按照考生志愿顺序依次投档,由高校审查录取。高校要尊重考生的院校志愿和专业志愿,正确处理好考生成绩与志愿的关系,当同批录取控制分数线上第一志愿的考生电子档案不足时,不得拒录非第一志愿报考的考生。

9.除军事、国防和公共安全等部分特殊院校(专业)外,在津招生高校不得规定男女生录取比例,不得对报考非外国语言文学类专业的考生作统考外语语种限制,不得在国家招生政策规定外作其他限制。除国家规定的情形外,在津招生高校不得提前组织考生面试、测试,并作为录取依据。

10.根据教育部和天津市减少和规范高考加分项目和分值的有关规定,有下列情形之一的考生,在其文化统考成绩总分的基础上增加一定分数投档;达到高校投档条件的,由高校审查决定是否录取。同一考生如符合多项加分投档条件的,只能取其中幅度最大的一项分值。所有高考加分项目及分值均不得用于高校不安排分省招生计划的艺术类专业、高水平艺术团、高水平运动队、高校专项计划等招生项目。

(1)烈士子女,增加20分投档。

(2)在服役期间荣立二等功以上或被战区(原大军区)以上单位授予荣誉称号的退役军人,增加20分投档。

(3)自主就业的退役士兵,增加10分投档。

(4)归侨、华侨子女、归侨子女和台湾省籍考生,增加10分投档。根据市教委、市委统战部、市公安局、市民宗委和市台联五部门联合印发的《天津市关于进一步深化高考加分改革工作实施方案》(津教政〔2020〕1号)相关规定,自2023年高考起,该项加分分值均调整为5分。

(5)少数民族考生,报考天津市属高校时,增加5分投档。根据市教委等五部门印发的《天津市关于进一步深化高考加分改革工作实施方案》(津教政〔2020〕1号)相关规定,自2023年高考起,该项政策调整为,在本市所属高校录取时,少数民族考生,在与汉族考生同等条件下,优先录取。其中,对于在高级中等教育阶段,从“四区”(边疆、山区、牧区、少数民族聚居地区)的少数民族自治地区,包括自治州(盟)、自治县(旗)等,转学到本市就读的少数民族考生,面向本市所属高校投档时,在高考成绩总分的基础上增加5分向高校提供档案,由高校审查决定是否录取。

凡符合加分条件的考生,必须经过本人申报、有关部门审核、市区校三级网上公示后方能予以认可。高级中等教育学校还须按规定公示到考生所在班级。未经公示的考生及其加分项目、分值不得计入投档成绩并使用。申报考生必须按有关规定办理相关手续,交验相应的证件、证书,由区招办负责将相关证明材料装入考生纸介质档案。

11.平时荣获二等功或者战时荣获三等功以上奖励军人的子女,一至四级残疾军人的子女,因公牺牲军人的子女,驻国家确定的三类以上艰苦边远地区和西藏自治区,解放军总部划定的二类以上岛屿工作累计满20年军人的子女,在国家确定的四类以上艰苦边远地区或者解放军总部划定的特类岛屿工作累计满10年军人的子女,在飞或停飞不满1年或达到飞行最高年限空勤军人的子女,从事舰艇工作满20年军人的子女,在航天和涉核岗位工作累计满15年军人的子女,参加全国统考录取并达到有关高校投档要求的,应予以优先录取。现役军人子女报考军队院校的,可以由高校在投档比例范围内优先录取。

公安烈士、公安英模和因公牺牲、一级至四级因公伤残公安民警子女参加全国统考录取的,按照《关于进一步加强和改进公安英烈和因公牺牲伤残公安民警子女教育优待工作的通知》(公政治〔2018〕27号)的有关规定执行。国家综合性消防救援队伍人员及其子女参加全国统考录取的,参照军人有关优待政策执行。退出部队现役的考生、残疾人民警察参加全国统考录取并达到有关高校投档要求的,在与其他考生同等条件下优先录取。

经共青团中央青年志愿者守信联合激励系统认定,获得5A级青年志愿者的,达到有关高校投档要求的,在与其他考生同等条件下优先录取。

12.高水平艺术团及高水平运动队等特殊类型资格考生均在普通本科批次投档录取,未经高校测试合格并经“阳光高考”平台公示的考生一律不予投档。高水平艺术团等特殊类型资格考生最低录取控制参考线,原则上按照高校招生录取总成绩排名全市前30%的成绩划定。高水平运动队考生高考成绩,一般不低于我市本科批次录取控制分数线;对于少数体育测试成绩特别突出的考生,高校可根据教育部有关要求适度降低文化成绩录取要求。

13.定向就业招生与非定向招生同时进行投档录取。高校定向就业招生计划在该校调档分数线上不能完成的,可在该校调档分数线下20分以内、同批录取控制分数线以上,由市高招办补充投档,高校根据考生定向志愿择优录取;经降分仍未完成的计划,可采取征询志愿方式或就地转为非定向计划执行。

14.普通本科批次A阶段的高校在平行志愿投档后未完成招生计划的,市高招办将面向社会公布尚有招生计划的高校和专业,由高考成绩达到本科批次录取控制分数线且未被录取的考生自主选择填报。市高招办将向相关高校提供征询志愿考生电子档案,由高校审查决定是否录取。

普通本科批次B阶段的高校在平行志愿投档后未完成招生计划的,市高招办将面向社会公布尚有招生计划的高校和专业,由尚未被录取的考生先自主填报征询志愿,市高招办根据志愿填报情况,再划定B阶段征询志愿录取控制分数线。如招生高校在征询志愿录取控制分数线上仍未完成招生计划,经高校同意,可适当降低分数提供考生电子档案,由高校审查决定是否录取。

15.高职(专科)批次的高校,如在同批录取控制分数线上生源不足,经高校同意,可适当降低分数提供考生电子档案,由高校审查决定是否录取。

16.对高考成绩达到要求、身体条件能够完成所报专业学习、生活能够自理的残疾考生,高校不能因其残疾而不予录取。

17.我市录取工作将于7月上旬开始,8月上旬各批次录取工作全部结束。

18.招收保送生的高校须根据教育部规定,于4月10日前将本校已测试合格拟录取的保送生数据库上传至“阳光高考”平台。市招办将在“阳光高考”平台上审核确认后下载数据,并按程序办理录取审批手续。

单独组织招生考试的高校须按有关要求于6月30日之前向市招办报送有关拟录取数据和书面报告。

二、天津高考志愿填报技巧

“院校+专业组”即一个院校加一个专业组为一个志愿单位。一个院校可设置一个或多个院校专业组。每个院校专业组可包含数量不等的专业,同一高校选科要求相同的专业可分设在不同的院校专业组中。同一院校专业组内各专业的科目要求须相同。且专业调剂仅限于同一专业组内调剂。

学生可根据自己的兴趣特长,先确定喜欢的专业,再确定学校。如想报考 北京大学 的数学、化学、中文专业,则需要填报数学+ 北京大学 、化学+ 北京大学 、中文+ 北京大学 3个志愿单位,同时考生要关注每个专业对选科的要求,明确自己是否符合条件。该种方式不存在专业服从调剂,考生也不用担心被调剂搭配不喜欢的专业,不过填报志愿时一定要利用好各高校的专业投档线。

2023年考研分数线是存在上涨或者降低可能的。

2023年考研分数线可能会下降,受多种因素影响,考研政治单科分数线有可能下降,英语和数学可能会与去年持平。部分学科门类的会出现上涨,幅度为1分至2分左右。

考研总分是500分,其中数学150分、英语100分、专业150分,政治100分,2023年考研人数是474万,考试难度上,政治科目有点难,

综合多方面因素,2023年政治单科分数线有可能下降,英语和数学可能会与去年持平。部分学科门类的会出现上涨,幅度为1分至2分左右。

考研国家线总体上不会有大的波动,教育部会依据培养目标,生源情况及总体初试成绩情况,确定考生进入复试的基本要求标准,不会出现明显变化。如果报考人数明显增加或减少,分数线是存在上涨或者降低可能的。

考研总分:

考研总分为500分,政治100分,英语100分,高数或专业基础150分,专业150分。根据专业不同,设置的科目也不同。每年国家会根据当年招生总人数和各类专业招生人数等,划定一个最低的分数线。

1、政治、外语、数学和专业,总分500,政治和外语各100分,数学和专业各150分。

2、政治、外语、专业一和专业二,总分500分,政治和外语各100分,专业一和专业二各150分。

3、是政治、外语和专业综合,政治和外语各100分,专业综合300分,总分500分。

考研复试是考生在通过初试的基础上,对考生业务水平和实际能力的进一步考察。复试面试其实主要考察考生的综合素质能力、专业素质能力、思维能力及个人心态等方面考研复试关系到研究生是否能最终入选,是最后一道程序,因此在考研过程有起举足轻重的作用。

体细胞calling 算法综述 somatic single nucleotide variant calling algorithms

paper基本信息

paper name: A review of somatic single nucleotide variant calling algorithms for next-generation sequencing data doi :101016/jcsbj201801003

总结

call 变异的主要步骤为 mapping -> call 变异 mapping 的DNA工具主要为BWA RNA 工具为star 本文着重介绍了目前市面上的call变异的工具的原理 算法可以归纳为四类: 匹配肿瘤正常变异、单样本变异、基于 umi 的变异和 RNA-seq 变异

详细介绍一些算法

1预处理

预处理的主要目的是防止低质量的读取进入不同的评价过程。读取质量通常是通过平均基础质量得分、mapping质量得分和参考基因组的错配次数等来衡量的

gatkindelrealigner 和 BQSR (基准质量得分重新校准)

-提高识别插入的准确性 samtools 与 picard

-去除PCR重复(但在基于 pcr 的扩增序列测序应用中,不推荐使用这种方法,因为不同的 DNA 片段可以共享相同的基因组坐标。此步骤中还包括降采样,在此期间随机选择读取的子集以继续进行下一步。如果在特定区域进行降采样,则可以节省计算时间并提高覆盖的一致性,但也会使结果不确定。)

2call 变异

各种软件使用各自的算法call 变异

3后期筛选处理

测序有些情况会欺骗统计模型将它们作为真正的变异传递。大多数变量调用方应用阈值来识别这些位置,从而提高特异性。例如,链偏置过滤,捕获只有或主要观察到一条链的读数,在 Illumina 公司的一个常见错误读,链偏好过滤器依赖于fisher,以确定不平衡的链分布。许多过滤器集中于重复区域,如homopolymer, microsatellite, or low complexity regions,这些区域已知会由于排列和排序错误而导致错误。硬过滤器用于大多数变异调用者,要么完全拒绝某些区域的变异,要么依赖于经验硬阈值。

4匹配正常肿瘤来call 变异

下面介绍一下文章中介绍的各个软件的原理

其基本思想是利用肿瘤鉴定潜在的变异,并利用匹配的正常样本区分体细胞变异和germline变异丢失(LOH)。 VarScan2、 qSNP、 Shimmer、 RADIA、 SOAPsnv 和 VarDict 对于一个潜在的 SNV,VarScan2需要至少两个支持读 *** 作和8% 的 VAF (可由用户调整)。其他call 变异软件在他们的算法中有类似的阈值,这些阈值通常设置在一般 NGS 数据的噪声水平之上,并且期望过滤掉低水平的人为影响。接下来,在匹配的正常情况下分析潜在的 SNV 位点,以过滤掉非体细胞变异。2,Shimmer,SOAPsnv,和 VarDict 应用 Fisher 的精确测试22列联表的读数(参考值、非参考值和肿瘤值、正常值)。一个小的 p 值表明非参考读数不成比例地分布在两个样本中,因此提示体细胞变异。qSNP 和 RADIA 应用一系列启发式规则来标记在肿瘤中被充分观察到但在正常情况下弱或未被观察到的体细胞变异体。如果同一患者的 RNA-seq 数据可用,RADIA 将在综合分析中包括基因表达数据,以进一步减少假阳性。

联合基因型分析,SomaticSniper,FaSD-somatic,SAMtools,JointSNVMix2,Virmid,SNVSniffer,Seurat,和 CaVEMan 采用这种方式,假设肿瘤和正常的二倍体,并评估关节的可能性。突变calling是基因推理的必然结果。这些算法的核心是联合基因型的后验概率,由贝叶斯规则计算,即,

其中GT、 GN 为肿瘤基因型,DT 为正常基因型,DN 为肿瘤和正常基因型。先验基因型概率 p (GT,GN)可能依赖于全基因组 SNP 率、体细胞突变率、 Ti-Tv 比值等。数据的联合似然 p (DT,DN | GT,GN)可以通过二项式概率计算,将覆盖一个站点的基地视为独立的伯努利试验,其成功概率取决于基因型和排序错误率。一旦连接基因型被推断出来,体细胞的变异就自然而然地发生了。突变和体细胞突变用“评分”概括了突变的证据,这实质上是肿瘤与正常人具有相同基因型的对数转化概率。其中 GT ∈{ AA,AC,AG,AT,CC,CG,CT,GG,GT,TT }。体细胞分数较高的部位在肿瘤和正常组织中更可能有不同的基因型,并被鉴定为可能的体细胞变异体。 SAMtools 采用了同样的策略,但没有使用后验概率,而是使用对数似然比作为变体评分。 JointSNVMix2,Virmid 和 SNVSniffer 将这10个外显基因型分解为 AA,AB 和 BB (a 为参考基因,b 为非参考基因) ,因此将联合基因型分解为33表。体细胞变异调用等价于计算 p (Somatic) = p (AA,AB) + p (AA,BB) ,肿瘤中正常和杂合或纯合非参照的纯合参照概率。具体来说,JointSNVMix2应用一个分层贝叶斯模型来估计联合基因型概率。 Virmid 将肿瘤视为正常组织和体细胞突变的混合物,提供了肿瘤中正常组织的联合基因型和比例的联合估计。 SNVsniffer 采用启发式和联合基因型分析的混合方法。启发式分析中的高可信体细胞变异被直接报道,低可信变异需要进一步的联合基因型概率估计检验。 CaVEMan 应用期望最大化算法估计基因型概率。

由于肿瘤样本中存在罕见的异质亚克隆,二倍体假设可能过于简单。为了发现复杂肿瘤基因组中的变异,尤其是罕见亚克隆中的变异体,一些人放弃了二倍体假设和模型联合等位基因频率(fT,fN) ,而代之以联合基因型(GT,GN)。等位基因频率分析方法由斯 MuTect、 LoFreq、 EBCall、 deepSNV、 lololopicker 和 MuSE 使用。

MuTect 将体细胞变异调用定义为两个模型选择问题。在肿瘤方面,对两种模型进行了评价和比较: 野生型模型 M0和突变型模型 Mf,前者假定所有非参考读数均来自技术伪造,后者假定变异等位基因以未知频率存在。通过计算对数似然比(LOD score)来选择更好的拟合模型。潜在突变位点(高 LOD 值) ,另一个模型选择正常进行比较广型模型 M0和杂合子模型 M05。如果 M0强烈优于 M05,则该变异被标记为躯体变异。LoFreq、 EBCall、 deepSNV 和 lolololopicker 将调用的变量表示为一个假设检验问题,其中零假设是野生型的,替代假设是变异的,检验统计量是观察到的非参考读数 nT。

LoFreq 将每个基地视为一个独立的 Bernoulli 试验,具有不同的“成功”概率,其中成功被定义为非参考,而成功的概率由质量得分决定。在这种情况下,nT 服从泊松-二项分布,p 值可以作为观察到比 nT 更多的非参考读数的概率来计算。

由于已知体细胞变异在某些热点、序列上下文和非编码区域富集,所以 EBCall、 deepSNV 和 LoLoPicker 可以估计特定位点的错误率,因此可以在每个位点设置明确和更准确的检测限。尤其是,deepSNV 和 lololopicker 被设计用于调用具有目标测序数据的低频变异。和 deepSNV 并不依赖于质量分数来推断出错误率,而是假设在每个目标位置,错误率是一个随机变量,遵循一个 Β分布。在无效假设下,nT 遵循一个 β-二项式分布,并相应地计算 p 值。在 EBCall 中,Β分布参数是从其他独立控制样本的序列中获得的。在 deepSNV 中,利用肿瘤样本和正常样本进行参数估计。

LoLoPicker 也采用了类似的策略,但对站点特定的错误率假定为固定值进行了重要修改。对于福尔马林固定和石蜡包埋(FFPE)等低质量样品的变异调用,特定地点的错误率特别有用,因为与新鲜样品相比,这些地点之间的错误率更高,更不平衡。然而,估计特定地点的错误率需要对大量样本进行排序,这并不总是可行的。

MuSE 将体细胞 SNVs 视为 DNA 的结果,并用状态空间为 a,t,g,c 的连续时间马尔可夫过程建模。非参考等位基因的平衡频率比较样本特定的阈值从独立的公共数据集。

基于单体类型的策略(相对于主流的基于位置的策略)被结构变异calling软件广泛采用,这些calling 软件需要将读取的内容组合起来以重建长变异。这也是Platypus、 HapMuC、 LocHap、 FreeBayes 和 mutett2使用的检测 SNV 的强大策略。这些算法在局部集合读取一个区域并生成候选单体类型,这些候选单体类型可以用 de Bruijn-like 图表示。每个单体类型的可能性是通过将每个读到的单体类型对齐并计算读支持度来估计的。基于单倍型的变异调用方在变异密集区域具有优势,因为它们不依赖于局部对齐,而局部对齐在困难区域是容易出错的。基于单倍型的调用方还提供了关于变体共存的额外信息。对于基于单体类型的调用方,indel 重新对齐不再有效,因为原始的本地对齐信息被丢弃,读 *** 作被组装和重新对齐。

机器学习方法在分类方面发展迅速,而变异调用本质上是一个分类问题。变异 seq,SomaticSeq,snoop 和 BAYSIC 是应用机器学习方法的典型变异调用方。变异 seq 提取每个站点的相关特征,并基于这些特征和一组“基本事实”的体细胞变体训练4个分类器(随机森林、贝叶斯自适应回归树、支持向量机和 Logit模型)。然后在测试数据集上测试训练后的分类器。

SNooPer 训练一个随机森林分类器,用于处理低覆盖率数据。

SomaticSeq 遵循相同的有监督的训练测试过程,但在两个方面不同于 MutationSeq 或 snoop。首先,采用自适应 boosting 算法进行分类。其次,它是一个集成变量调用程序,需要将来自其他软件(MuTect、 SomaticSniper、 VarScan2、 JointSNVMix2和 VarDict)的变量调用联合起来作为起点,然后应用自己的分类器去除假阳性。

BAYSIC 也是一个集合变量调用程序,它使用一个无监督的潜在类模型来组合多个调用。

补录是为那些没有被大学录取的同学一个再次上大学的机会,很多同学都会关心补录降多少分,针对这个问题我来问大家解答一下。

1 什么是专科补录

专科补录是一些大专院校在第一次招生的时候因为填该学校的人少,没有招满,然后进行的第二次录取。或者招满人,到有学生未去报到,被自动取消入学资格而空出的名额。补录的时候也需要填志愿,大多为平行志愿,一般到时候各省的招生办就会发出通知,告诉考生哪些学校哪些专业会进行补录,这时候你如果没有录取上就可以填这些学校进行补录。

1 专科补录会不会降分

各大学的降分标准都是不一样的,有些学校由于补录的学生填报比较少,降分就会比较多,填报的学生多的学校,降分自然就会比较少,当然,还有一种更夸张的情况,就是补录学生太多,而造成分数线反而高于该学校本来的分数线。一般而言,分数线都会降10-15分。

1 专科补录的程序是什么

1、补录以考生重新填报的志愿为准,考生原填报的志愿无效。有意向参加补录的考生,必须重新填报志愿。

2、已经被高校录取的考生,不得申请补报志愿。

3、补报志愿的考生,其本人的选考科目必须与院校缺额专业的选考科目要求相符。(填其他学校是不承认的,填了没有效用)

4、参加补报志愿的普通、体育类考生,每人可填报3所院校志愿,每所院校均可填报6个专业志愿。普通类与体育类不得同时兼报。高职类考生每人可填报2所院校志愿,每所院校均可填报4个专业志愿。

5、考生志愿以通过“普通高考补报志愿系统”录入正确后打印的志愿表为准,考生必须在系统打印出的志愿表上签名确认。凡补报志愿后没有打印“xx省普通高考补报志愿表”的考生,其补报结果以省考试中心“普通高考志愿补报系统”中的补报结果为准。

6、考生要对自己填报志愿的准确性负责。考生志愿信息一经确认,任何人不得更改。

7、市、县(区)招生考试机构确认考生补报志愿时不要通过代理服务器上网,并且不允许同时打开两个IE窗口,以确保考生志愿信息及时准确地录入。

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