为什么要进行细胞株鉴定(Cell Line Authentication)?

为什么要进行细胞株鉴定(Cell Line Authentication)?,第1张

细胞生物学方面的数据一直在发表,但是应用于生物医学研究领域的哺乳动物细胞被错误鉴定和交叉污染的问题,一直是一个普遍存在的突出问题。早在1970年代,一项研究就发现,被广泛使用的Hela细胞系就曾被污染,这一事件当时就促使首个细胞系质量控制手册的诞生。HeLa细胞株是由正常子宫颈细胞被一 人类乳突状瘤病毒(Human Papillomavirus 18或HPV18)转型成癌细胞的,而且和正常子宫颈细胞有许多不同。

从那时候开始,细胞身份鉴定成 一个受科学家关注的问题,也是从那时候开始越来越多的细胞被污染事件开始出现。人们已经开始意识到细胞被污染的问题,导致细胞交叉污染的原因和预防措施也已经被公布,然而问题却一直有增无减,研究人员继续发表从错误鉴定和交叉污染的细胞系所获取的数据。

据估计, 国外实验室已建株细胞有接近 20% 存在上述问题, 有 15-25% 的研究论文因为使用了被错误辨识和交叉污染的细胞而导致错误的结论。这造成大量研究经费的浪费,并产生了大量无效或错误数据。

2008年,Josephine Nefkens研究所的分子生物学家Winand Dinjens与同事发现食管腺癌细胞其实与食管扁平细胞癌细胞系具有相似的基因型。这些结果促使他们开始关注细胞身份问题。 Dinjens开始验证这些细胞系,将它们与原始的组织进行基因型比对,结果发现,这些细胞系与原始组织细胞已经有不同的基因型。在13株食管腺癌细胞系中,其中3株:SEG-1,BIC-1和SK-GT-5被污染,这些细胞株混合有其他癌细胞。这些细胞系已经被多家实验室应用在两个临床试验、并发表了超过100篇SCI文章,并申请了11个美国专利,这一研究结果被发布在最新一期的Journal of the National Cancer Institute(JNCI)。

2007 年 NIH发布了通知,强烈建议在使用培养细胞的时候进行鉴定(authentication)。2008 年底,专家提议ATCC致力于人源细胞系的鉴定工作,并制定鉴定的标准程序。

近年来,大量研究表明 STR 基因分型 方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一,STR基因分型应用于细胞鉴定已被ATCC等机构强烈推荐。美国的ATCC 细胞库、德国的DSMZ细胞库以及日本的JCRB细胞库等为STR 分型提供了各细胞株的数据供比对。

国内专业的鉴定机构苏州鉴达生物科技(Genetic Testing Biotechnology)就在江苏省苏州市工业园区,可以邮寄细胞株进行鉴定,起步比较早,提供的英文报告可直接用于投稿。

细胞株(Cell lines)作为科研工作者常用的工具,主要用于生物医学研究的体外实验(In vitro)研究。截止目前,被ATCC及DSMZ官方数据库收录的商用细胞株约为4000种左右。近年来,随着细胞株的广泛应用,细胞株被错误鉴定和交叉污染问题显得尤为突出。为了确保实验结果的可重复性,NIH和ATCC近期对此发出呼吁,要求研究者对细胞株进行鉴定,已明确所使用细胞的身份。多种主流杂志也纷纷要求作者在投稿时提交细胞株鉴定(Cell Line Authentication)报告,有些杂志甚至要求作者提供实验前、实验中和实验后等不同阶段的细胞株鉴定报告。

大量研究表明STR Profiling方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一,STR Profiling应用于细胞鉴定已被ATCC等机构强烈推荐。苏州鉴达生物科技(Genetic Testing Biotechnology(Suzhou))目前采用六色荧光复合扩增体系,可同时检测20余个STR基因座,获得每个基因座的STR分型结果。根据ATCC推荐的8个核心STR基因座数据进行检索匹配,来确定细胞株身份。该方法灵敏度高,可检测低至10ng的基因组DNA,且能排除非人源DNA的污染,为广大科研工作者提供了方便快捷的细胞株鉴定绿色通道。

用户只需提交细胞悬液样本,直接送检或邮寄细胞样本。一般一个工作日出具英文鉴定报告,报告可直接用于外文杂志投稿。目前应用苏州鉴达生物科技报告已发表的论文期刊包括Caner Res,Carcinogenesis,Intl J Cancer等。


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