kegg如何查找乳酸菌通路

1、首先打开KEGG数据库，你会进入下面这个界面，点击KEGGPATHWAY。

2、红框标识的是PATHWAY的一级分类，蓝框框住的是二级分类。比如第一个Metabolismpathway的二级pathway已经列出来了。如果我想找细胞凋亡相关的通路，是有一个cellularprocess，很明显我们的通路应该在这里。

3、点击cellularprocess，页面迅速的跳到这部分的二级pathway了，这时你可以看到二级通路下面更细化的通路，且确实有我们想要找的信息。以上kegg如何查找乳酸菌通路。

可以。

我们可以利用KEGG数据库中的KEGGMapper工具查询多个基因信号通路。根据基因表达差异列表，利用KEGGMapper进行转换。

首先，我们将需要查询的基因名称在Uniprot网址上进行ID转换（见前一篇文章），形成的Excel文件中Entry那一栏就是我们查询到的基因UniprotID了。

根据表达差异，将含UniprotID和Expression对应，值得注意的是部分基因查询不到对应的Uniprot，或者一个基因对应多个Uniprot，根据自己的内容选择对应的。可以设置颜色对表达上调或下调进行颜色区分，在Entry一栏旁设置一栏color，我们可以上调设置为“red”,下调设置为“blue”。（颜色必须用英文小写字母，大写不能识别）。然后将Entry 和color两栏复制，输入“Enterobjectsoneperlinefollowedbybgcolor,fgcolor”,点击“Exec”。

根据查询结果，选择你需要的结果。我们选择第一个，TGF-beta信号通路（human）。这样我们很清晰的看到我们查询的基因在TGF-Beta信号通路中位置和关联。并且通过颜色即可识别该基因上调还是下调。

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