R语言处理PCR数据,一步画柱状图、添加显著性标志并实现截断

R语言处理PCR数据,一步画柱状图、添加显著性标志并实现截断,第1张

PCR数据要有三列,一列是组名,一列是内参基因的CT值,一列是目的基因的CT值,计算方法是-2 ∆∆Ct 法,实现一步出图用的是 ggpubr ,实现截断则是Y叔出手的 ggbreak

以前很少有包可以完美实现这个功能,我以前写过 R做截断柱状图并加显著性统计 可以实现,但Y叔出手写了个 ggbreak 包,完美的就解决了

其实还有一个 pcr 的包也能简单实现,而且自动计算mRNA相对表达定量,而且对照组定量是1,更加科学,但是表格只是两列CT值,还要重新定义组,所以要先提取一下表格,处理一下数据。

也可以截断,还是 ggbreak

CAD标注线可以截断,方法具体如下:

如图所示,单击”打断“命令按钮,提示”选择要添加/删除折断的标注“,单击选取尺寸标注;提示中增加了”自动“、”手动“参数选项,默认为自动,直接按Enter键将自动打断尺寸线,结果如图中右上部分所示。

如图所示,输入参数m,按Enter键确认,提示”指定打断点“,借助对象捕捉功能,单击选定打断点,结果如图中右上部分所示。

如果2D图片数据标注中的目标被截断,需要在截断的部分画框时,可以采用以下两种方法:

1、根据截断部分的实际情况,通过推测来判断画框的位置和大小。例如,如果目标的一部分被遮挡,可以根据已标注的目标轮廓和遮挡部分的形状,推测出未遮挡部分的位置和大小,然后在该位置画框。

2、如果无法确定目标被截断部分的具体位置和大小,可以将标注框画在未被截断的部分,然后在标注时添加注释,说明该目标被截断的情况,以便后续处理时更加准确。


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原文地址: https://www.outofmemory.cn/bake/11371510.html

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