单细胞实战1:两样本合并

单细胞实战1:两样本合并,第1张

从读取表达矩阵到建立seurat对象都在服务器上进行(文件太大)
建立Seurat对象后,saveimage,之后转移到电脑上 *** 作。
读取表达矩阵

将dataframe转化为matrix,遇到报错

原因:电脑内存不够
mac解决:打开终端
步骤1:打开终端,

步骤2:
cd〜
touch Renviron
打开Renviron

步骤3:将以下内容保存为 Renviron 的第一行:

< pre> R_MAX_VSIZE = 100Gb

注意:此限制包括物理限制和虚拟内存;因此,在具有16Gb物理内存的计算机上设置_MAX_VSIZE = 16Gb可能不会防止此错误。您可能需要使用此参数,具体取决于计算机的规格
(参考: >我用的是jmeter,写的不够专业请见谅,基本就是在一定时间内发起若干个并发连接,然后每个连接执行一次登陆 *** 作和查询 *** 作,对返回结果进行成功或失败判断。最终得出一个结论,比如我得到的是:
样本数量:5500;
平均连接时间:21毫秒;
95%的样本连接时间低于33毫秒;
错误率:0%;
服务器吞吐量:每秒544次;
数据流量:每秒30053KB。
当然也可以用其他软件,不过大部分都是linux下的,windows下不多,我只试用过一个pylot,需要python支持,相对jemter功能更加简单,不过设置也简单。

linux时间同步命令的方法:

可以使用ntpdate命令。ntpdate命令使用网络时间协议(NTP)设置日期和时间,通过轮询指定的确定正确时间的NTP服务器来设置本地日期和时间。它从指定的每个服务器获得了一些样本,并应用标准NTP时钟过滤器和选择算法来选择最好的样本。命令格式:ntpdate时间服务器。


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原文地址: http://www.outofmemory.cn/zz/13479941.html

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