做代谢组学检测的血液样本怎么采集与前处理

做代谢组学检测的血液样本怎么采集与前处理,第1张

整体。既包含CRO公司品牌、商誉、组织人才、实施案例、客户口碑、公司大小,还包含技术细节、设备实力、人才能力、数据处理能力、服务效率、服务人员是否经验丰富、数据库量和质,此外,还有自己的资金支持、重视程度、目标层次不同等自身需求原因。

全过程。代谢组学又包含样本前处理、数据获取、峰检测、峰对齐、差异特征筛选、化合物鉴定、二级谱验证、定量检测等流程,其中除了实验标准,质量把控要严格外,一直被大家疏忽的还有数据处理部分,如果检测信号不准确,批次效应无法对齐,不同方法得到的实验结果完全是不一样的。下面实验时我用相同数据,采用不同软件得到的PLSDA结果图,可以看到左边图完全分不开,右侧图能够清晰分开,可以看出不同峰检测算法对于信号的检测对比差异非常明显。所以,我们需要把控实验前处理质量和方法的同时,还需要考察CRO公司的数据处理能力。

核心。有无自建的谱图数据库和高精度的智能峰检测算法,对于提高化合物覆盖度、鉴定率、准确性至关重要,不同数据处理方法的结果是天差地别的。

1百趣生物

成立时间:2012(最早是阿趣生物)

地点:上海

市场份额:14%

公司人数:约300人

公司介绍:国内最早专门从事代谢组学科研服务的公司之一,主打非靶标代谢组学检测分析服务,其优势是数据质量,据说能做到美国metabolon的水平,CV<10%。公司创始人源自于复旦大学及中科院,首席科学顾问为代谢组学学会秘书长、中科院朱研究员。

2迈特维尔

成立时间:2015

地点:武汉

市场份额:14%

公司人数:约300人

公司介绍:国内最早专门从事农林作物代谢组学科研服务的公司之一,主打广泛靶向代谢组学检测分析服务,其优势是植物天然产物数据库比较完善,公司创始人源自于华中农业大学,首席科学顾问为原华中农业大学罗教授。

3中科新生命代谢

成立时间:2004

地点:上海

市场份额:10%

公司人数:约300人

公司介绍:国内非常老牌的蛋白质组学公司,原来是中科院控股的企业,后来市场化,改由中科院营养与健康所参股,2017年左右开始做代谢组学。

4诺禾致源质谱

成立时间:2011

地点:北京

市场份额:7%

公司人数:质谱团队约150人

公司介绍:国内测序服务龙头,2021年科创板上市,市值130亿,2018年左右开始做代谢组学,优势是销售多,很容易找到。

5鹿明生物

成立时间:2016

地点:上海

市场份额:7%

公司人数:约100人

公司介绍:欧易生物下属企业,做蛋白质组学和代谢组学服务。欧易生物属于老牌的基因测序服务企业,最近几年发展的也很好。鹿明创始人是农科院的一名博士。

6帕诺米克

成立时间:2012

地点:苏州

市场份额:7%

公司人数:约150人

公司介绍:苏州帕诺米克(BioNovoGene)最早是做基因检测服务的,2017左右聚焦做代谢组学,改名为诺米代谢(PanoMIX),公司2021年获得元生创投亿级融资。

7麦特绘谱

成立时间:2016

地点:上海

市场份额:5%

公司人数:约100人

公司介绍:原交通大学贾教授创立的科研服务公司,随后贾教授在深圳设立了绘云生物,收购了麦特绘谱。鉴于贾教授在代谢组学领域资深的影响力,麦特绘谱可以提供深度的服务。

8凯莱谱

成立时间:2016

地点:杭州

市场份额:5%

公司人数:约100人

公司介绍:上市公司迪安诊断控股公司,最早与美国Metabolon建立技术合作。创始人来自Sciex资深应用专家。公司后来独立融资,转型为临床诊断的公司,准备上市中。

9中科脂典

成立时间:2015

地点:常州

市场份额:5%

公司人数:约50人

公司介绍:中科院遗传与发育所参股企业,创始人为中科院税研究员,税老师是国内脂质组学领域非常有影响力的专家,所以公司也是比较专注做脂质组学。

10拜谱生物

成立时间:2017

地点:上海

市场份额:5%

公司人数:约50人

公司介绍:拜谱生物提供蛋白质组学、代谢组学、基因组学和转录组学技术服务。创始人是从中科新生命出来的行业资深人士。

代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生物整体、器官或组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物事件。  代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息。如同我们在长江的上游建大坝或对江水改道,这些项目的生态影响会在下游的河道和地域体现出来一样,我们经常说,基因组学和蛋白组学告诉你可能发生什么,而代谢组学则告诉你已经发生了什么

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