python – 基本的paramiko exec_command帮助

概述我是一个新的paramiko用户,并且很难在paramiko的远程服务器上运行命令.我想导出一个路径,并在后台运行一个名为tophat的程序.我可以使用paramiko.sshclient()登录,但我的exec_command代码没有结果. stdin, stdout, sterr = ssh.exec_command('export PATH=$PATH:/proj/genome/progra 我是一个新的paramiko用户,并且很难在paramiko的远程服务器上运行命令.我想导出一个路径,并在后台运行一个名为tophat的程序.我可以使用paramiko.sshclIEnt()登录,但我的exec_command代码没有结果.

stdin,stdout,sterr = ssh.exec_command('export PATH=$PATH:/proj/genome/programs/tophat-1.3.0/bin:/proj/genome/programs/cufflinks-1.0.3/bin:/proj/genome/programs/bowtIE-0.12.7:/proj/genome/programs/samtools-0.1.16')stdin,sterr = ssh.exec_command('nohup tophat -o /output/path/directory -I 10000 -p 8 --microexon-search -r 50 /proj/genome/programs/bowtIE-0.12.7/indexes/ce9 /input/path/1 /input/path/2 &')

没有nohup.out文件,python只是转到下一行,没有错误消息.我也试过没有nohup,结果是一样的.我试图遵循this paramiko tutorial.

我是否正确使用exec_command？

解决方法 我也遇到了同样的问题,在查看了 this article和 this answer之后,我看到解决方案是调用Channel的recv_exit_status()方法.这是我的代码：

import paramikoimport timecli = paramiko.clIEnt.SSHClIEnt()cli.set_missing_host_key_policy(paramiko.clIEnt.autoAddPolicy())cli.connect(hostname="10.66.171.100",username="mapPing")stdin_,stdout_,stderr_ = cli.exec_command("ls -l ~")# time.sleep(2)    # PrevIoUsly,I had to sleep for some time.stdout_.channel.recv_exit_status()lines = stdout_.readlines()for line in lines:    print linecli.close()

现在我的代码将被阻止,直到远程命令完成.这个方法在here解释,请注意警告.

总结

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